Если исходник 16/44.1, то перегонять при прожиге в 48 или в 96кГц - только портить звук. Именно из-за принудительной передискретизации потока 44.1 -> 48 зачастую DVD-плееры хреново воспроизводят музыкальные CD.
(Слава богу хоть Дживисы этим не занимаются...)
Так что "чудеса натворить" и правда можно.