Я может не совсем понял - но вопрос стоял как:
я записываю "дома" свою аудиотеку, правлю, добавляю и удаляю.. Но если на "работе" пытаюсь что-то добавить, то тельце синхронизируется с "рабочей" аудиотекой. 
Я в свое время пытался погуглить этот вопрос, но так и не нашел решения. Может плохо искал, может решения все аккурат до обновления тунца, но лично для меня этот вопрос так и остался открытым. Было более-менее рабоее  решение, но после того как на работе добавлял и оно играло, дома после синхронизации эти добавленные альбомы были серым цветом помечены и играть после синхронизации отказывались. Ношу на работу на флешке и там добавляю 

 Все трудности были с Iphone, Ipad пока не пользовал... хотя сомневаюсь  что с ним будет по другому. 
Как альтернатива записывать в медиапроигрыватель в тот же AVplayer сразу   флак (принимает - но как 1 файл и подряд же и играет) и оттуда пользовать. Либо туда же Mp3 писать - но явно стандартный яблоковский проигрыватель рулит перед всеми опробованными медиапроигрывателями.